Ide berdirinya Program Studi Ilmu Keperawatan Fakultas Kedokteran dan Kesehatan Universitas Muhammadiyah Jakarta dilandasi oleh cita-cita terciptanya pelayanan keperawatan yang professional dan Islami, untuk itu pada tahun 1999 mulai dibentuk Kelompok Kerja Keperawatan (POKJA) yang bertempak di AKPER RSIJ. Untuk itu POKJA melakukan bberapa kajian dan rapat kerja yang diselenggarakan di Concorcium Health Science (CHS), AKPER RSIJ, UMJ dan Universitas Muhammadiyah Jogjakarta. Kerja Keras POKJA menghasilkan sebuah buku yang berjudul “Buku Keperawatan Islam”.
Pada perjalanannya kemudian tim perijinan yang dibenuk antara AKPER RSIJ dan FIKES UMJ pada tanggal 8 Februari berhasil mendapatkan Surat Keputusan Nomor 41/DIKTI/Kep/2001. Tentang ijin pembukaan Program Studi Ilmu Keperawatan. Dengan Demikian pada tahun akademik 2001-2002 Program Studi Ilmu Keperawatan dibawah Fakultas Ilmu Kesehatan Universitas Muhammadiyah Jakarta membuka pendaftaran mahasiswa baru angkatan pertama dari Program A (SMU sederajat) dan Program B (Dari DIII Keperawatan).
Program Studi Ilmu Keperawatan ini diselenggarakan sebagai wujud peran serta Universitas Muhammadiyah Jakarta dalam pembangunan bangsa melalui pendidikan bidang kesehatan khususnya perawatan kesehatan. Disamping itu pula dalam rangka menjawab tantangan kebutuhan masyarakat akan pelayanan keperawatan yang professional, memiliki integritas iman dan taqwa, berilmu pengetahuan serta berakhlakul karimah yang mampu memberikan pelayanan berkualitas. Tahapan pendidikan meliputi tahap akademik dan tahap profesi. Peserta didik yang telah menyelesaikan Tahap Akademik akan mendapatkan gelar Sarjana Keperawatan (S.Kep). Dan setelah menyelesaikan tahap profesi akan mendapatkan gelar NERS (Ns).
Pada awalnya Program Studi Ilmu Keperawatan berada dibawah naungan Fakultas Kedokteran dan Kesehatan. Namun dalam upaya menguatkan institusi Universitas Muhammadiyah Jakarta dalam persaingan pendidikan tinggi sehingga semua komponen pada program studi keperawatan sepakat untuk membuka Fakultas Ilmu keperawatan yang diresmikan pada tanggal 4 April 2013. Hal ini berdasarkan Surat Keputusan Rektor Universitas Muhammadiyah Jakata Nomor : 194 tahun 2013 tentang Pembukaan Fakultas Ilmu Keperawatan Universitas Muhammadiyah Jakarta. Dimana Program Studi Ilmu Keperawatan telah diputuskan menjadi salah satu program studi Fakultas Ilmu Keperawatan Universitas Muhammadiyah Jakarta. Program Studi yang berada dibawah naungan Fakultas Ilmu Keperawatan adalah Program Studi Ilmu Keperawatan Strata Satu (S1), Program Studi Diploma Tiga (D3) Keperawatan, dan Program Studi Magister (S2) Keperawatan.
